Sejarah Berdirinya Madrasah Ibtida,iyah ALHuda Madrasah sebagai nama bagi suatu lembaga atau wadah yang mewadahi proses transformasi ilmu telah mengalami perkembangan pemaknaan dalam rentang sejarah perkembangan umat Islam sejak zaman Rasulullah SAW sampai sekarang. Madrasah dimaknai sebagai istilah yang menunjuk pada proses belajar dari yang tidak formal sampai yang formal. Madrasah adalah salah satu jenis lembaga pendidikan Islam yang diusahakan, di samping masjid dan pesantren. Proses kelahiran dan dinamika madrasah sebagai salah satu lembaga pendidikan Islam formal di Indonesia yang merupakan perkembangan lanjut atau pembaruan dari lembaga pendidikan pesantren dan masjid/surau.

Termasuk MI (Madrasah Ibtidaiyah) Alhuda ,yang ada di Desa Pongpongan Kecamatan Merakurak. Awalnya bermula dari ngaji pada umunya di mushola mushola di tahun 1980 an seiring berkembangnya waktu akhirnya di sentral di Masjid dengan sestem diniyah sampai tahun 1986, dan di tahun 1987 merintis MI dan masih masuk sore ,anak anak paginya sekolah di SD Dan sore harinya sekolah di Madrasah Ibtidaiyah ALHuda, baru mulai tahun 1995 mendirikan RA ( roudlotul Atfal ) sebagai cikal bakal MI masuk pagi kemudian menjadi madrasah formal . Kini MI AL Huda pelan-pelan berubah menjadi Madrasah mandiri ” dan menjadi madrasah dari sekian Madrasah yang ada di di kecamatan Merakurrak. Sebelum 1985,sebelum ada madrasah di Desa Pongpongan, Merakurak. Kehidupan masyarakat Desa masih belum tersentuh dengan pengajaran formal melalui madrasah. Saat itu, pembelajaran yang terjadi baru sebatas anak-anak dan remaja remaja juga sebagian kecil orang dewasa yang mengaji .Mengajinya pada waktu itu yaitu mengaji Juz Ama (turutan )Alquran ,kitab kitab fiqih, nahwu, shorof ,pasolatan dan kitab lainya kepada Kiai setempat, Dari kegiatan ngaji itu, akhirnya dibentuklah pengurus Diniyah yamg di ketuani Pak Sukardi dan guru ngaji lainya. Waktu itu Ngaji seolah seperti madrasah, tapi berbentuk diniyah dan pelajaran yang diajarkan adalah dari kitab Sulam Safinah, nahwu shorof dan kitab an pelajaran lainya.

Seiring bertambahnya waktu MI Alhuda terus berkembang sampai sekarang liku liku perjuangan Madrasah penuh dengan kenangan kita semua dalam perjalananya mulai penyediaaan sarana dan prasarana lainya ,Alhamdulillah sampai sekarang lokal sudah tercukupi baik dari RA ataupun MI nya walaupun belum sempurna Pada 1987, atas tekat bersama para kiai, tokoh masyarakat dan desa yang di motori bapak Kepala Desa Pongpongan bapak Warmuji dan perangkat lainya terutama Mbah Modin Lamijan didirikanlah madrasah dengan gedung pertama satu bangunan dengan 2 lokal kelas dan satu kantor yang masih “sederhana ”. Yang letak madrasah itu dulu di sebelah Masjid Abdulloh . Pada saat itu Murid MI Alhuda saat itu mencapai 90 anak dan gurunya berjumlah 5 orang: Sami,an ,Suryono ,Kusnan,windari ,wartini,.

Pada tahun 1996-2001 kurang lebih berdiri selama 5 tahun juga pernah mendirikan MTs / madrasah Tsanawiyah yang berafiliasi dengan MTs Salafiyah Merakurak waktu itu masuk Sekolah masuk sore , hal itu disebabkan karena Gedungnya kalo pagi di pergunakan oleh MI ,dan guru gurunya meragkap di MI juga  Namun, madrasa Tsanawiyah saat itu hanya berjalan 5 tahunan.setelah itu karena jumlah siswanya gurang dari 10 anak perkelas ahkirnya siswa siswa lulusan MI yang mau daftarkan ke Mts kami arahkan ke MTs Salafiyah Merakurak kembali . Dan pada Tahun 1987 MI ALHuda Pongpongan sudah menyesuaikan kurikulum dari departemen agama dan semakin berkembang sampai sekarang ,yang mempunyai 1 lokal gedung RA dan 3 lokal gedung MI yang 1 lokalnya berlantai 2. Sampai saat ini hingga menjadi madrasah Merakurak berkembang di kecamatan Merakurak Kabupaten Tuban.Sebagai lulusan Madrasah A.